бэкапить сайт должен каждый нормальный хостер, ежедневно.
вручную, бэкап баз SQL подобных можно делать несколькими способами: через Cpanel, phpMyadmin, через движок (если эта функция есть в админке), через спец. скрипты.
полностью сайт можно забыкапить через cpanel (при этом получается файл сжатый gzip) или тупо скопировать все файлы через ftp к себе на комп.