Во-первых, это массовость.
Во вторых, многим понравится работать именно в Windows, а не через web-интерфейс.
- вы сможете проконтролировать интернет-трафик программы при помощи, скажем, брандмауеров. С веб-сервисами такое проделать невозможно: им остается поверить на слово, что информация о запросах не передается киберсквотерам
- программа позволяет ввести неограниченное число доменов для проверки, у веб-сервисов как правило это число ограничено.
- импорт исходных данных и экспорт результатов.
Можно привести и дргуие плюсы по сравнению с веб-страницами, определяющим ху-ис